Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VARSP26640 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VARSP26640 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VARSP26640 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VARSP26640 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VARSP26640 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VARSP26640 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VARSP26640 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VARSP26640 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VARSP26640 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms