Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL8A2P25067 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL8A2P25067 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL8A2P25067 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms