Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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