Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYF6P23409 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYF6P23409 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms