Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms