Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BCL3P20749 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BCL3P20749 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCL3P20749 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms