Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms