Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD53P19397 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD53P19397 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms