Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRF1P14222 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRF1P14222 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms