Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms