Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RALAP11233 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RALAP11233 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RALAP11233 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RALAP11233 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RALAP11233 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms