Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC166P0CW27 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms