Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SBK2P0C263 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SBK2P0C263 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms