Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRB1P04280 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRB1P04280 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRB1P04280 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms