Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM37O94972 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms