Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF6O75683 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SURF6O75683 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms