Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms