Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms