Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SELENOFO60613 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms