Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSPNO60542 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSPNO60542 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSPNO60542 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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