Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms