Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM6AO15550 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms