Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms