Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
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