Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms