Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms