Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms