Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBAL3A6NHL2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBAL3A6NHL2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms