Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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