Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN6Q9Y6Q1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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