Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms