Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNSTRNQ9Y448 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms