Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REXO2Q9Y3B8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms