Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP3Q9Y2W1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP3Q9Y2W1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms