Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL20Q9Y2M5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms