Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms