Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms