Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms