Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCTN4Q9UJW0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms