Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms