Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SS18L2Q9UHA2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SS18L2Q9UHA2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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