Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4Q9UBX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms