Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms