Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms