Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms