Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PHRF1Q9P1Y6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms