Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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