Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT1Q9NXH9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms