Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms