Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms